徳島文理大学香川薬学部は、１９８３（昭和５８）年に 香川県さぬき市（当時・志度町）に設立した香川キャンパスへ２００４（平成１６）年に設置されました。その翌年には大学院香川薬学研究科が設置されました。そして、０６（平成１８）年の学校教育法等の変更で薬学教育が６年制へ移行したことに際して、薬学部は６年制の薬剤師養成を目的とした充実の薬剤師免許取得プログラムにより、薬のプロフェッショナルとしての薬剤師を目指す薬学科と薬の科学探求プログラムにより、薬の科学者を目指す４年制の薬科学科に分けられました。なお、徳島文理大学は香川キャンパスの薬学部のほかに、徳島市内に本部がある本校－徳島キャンパスに１９７２（昭和４７）年に設立された薬学部がありますが、香川キャンパスのような４年制の薬科学科はありません。
第９４回薬剤師国家試験に臨んだ徳島文理大学薬学部の新卒・既卒の出身者は４７５名。そして、合格者は３７０名、その合格率は７７．８９％でした。この受験者数や合格者数には徳島キャンパスと香川キャンパスの内訳は不詳ですが、この合格率はこの試験を６１校の薬学部系国公立・私立大学のうちで、２９位という位置づけでした。
徳島文理大学香川薬学部の展開として、２０１０（平成２２）年に香川大学医学部や香川県内の薬局と連携し、全国に先駆けて「電子処方箋システム」の開発を行っています。この「電子処方箋システム」は、薬学系の専門紙・業界新聞で取り上げられています。
